要正确使用扶正与祛邪治则，其前提是必须首先在辨证上分清虚实证，尤其是对虚实真假混杂的证候，如真虚假实证和真实假虚证，要透过现象（特别是出现的假象）找到病证的本质。如果虚实诊断不准而错用扶正与祛邪治则，就会造成不良后果。若虚证用攻，则正气愈加消减衰弱；实证用补，则邪气愈加鸱张亢盛。尤其是虚证用攻的危害性更甚。《医门法律·卷一·先哲格言》说：“实而误补，固必增邪，犹可解救，其祸小；虚而误攻，真气忽去，莫可挽回，其祸大”。其次，在用药上要注意轻重缓急，扶正或祛邪方法的峻缓，以及处方、用药量的大小，都应该适合病情的性质和轻重。一般而言，扶正之法贵在长期坚持，药量宜先轻后重，用药应注意不可过量，不可影响脾胃的消化吸收功能，否则亦会酿成“药害”，非但不能补虚，反而会导致机体发生新的病变。祛邪之法，用药宜先缓后峻，并当中病即止，过用则易损伤人体正气，不利于恢复健康。

　　扶正不仅能治疗虚证，还能增强体质，提高机体的抗病能力。所以，扶正治则除了补气、补血、补阴、补阳等最常用的药物疗法外，还有针灸疗法、推拿气功疗法，以及精神调摄、饮食调养、体育锻炼等等，它们都是扶正的具体方法。例如饮食调养法，在《素问·脏气法时论》中就有“毒药攻邪，五谷为养，五果为助，五畜为益，五菜为充。气味合而服之，以补精益气”之说。说明药物一般长于攻邪，而食物则善于扶正补虚。

　　祛邪的具体方法很多，根据邪气的性质和邪气所在的部位，可以选择不同的祛邪方法。例如：邪在表者，用发汗解表法；邪在胸脘上部，如痰涎壅塞、宿食停滞或食物中毒等，宜用涌吐法；邪在胃肠下部，如热邪与肠中糟粕相结，宜用泻下法；里热证宜用清热法；里寒证宜用祛寒法；湿证宜用化湿、利湿法；食积胀满，宜用消导化积法；有痰饮者，宜用祛痰法；有瘀血者，宜用活血化瘀法，等等。选择具体祛邪的方法时，要注意使邪有出路，正如《读医随笔·卷四·证治类·用药须使邪有出路》所言：“凡治病，总宜使邪有出路。宜下出者，不泄之不得下也；宜外出者，不散之不得外也”。选择合适的祛邪方法，对尽快祛除邪气具有重要的临床意义。