四是创建科学的假说和构建新的理论体系。
在以继承性研究确立中医学某一基本理论和概念的内涵以及以现代科学手段对该理论和概念的内涵作深化研究的过程中,科学的假说和新的理论就可能孕育产生。如在比较研究中医学的精气理论与古代哲学的精气学说的过程中,在对藏象概念的内涵及其产生根源的探讨中,发现了现行的“脏腑气血阴阳”理论体系的诸多问题,产生了构建“脏腑—精气—阴阳”理论体系的想法,以科学地表述脏腑之精、气、阴阳的概念及其之间的逻辑关系,并较确切地表述脏腑的生理功能和病理变化。脏腑精气阴阳理论体系,实际上是一个新的脏腑功能和人体生命活动的解释性模型,对认识人体生命的来源,说明人体生命的持续和变化规律,指导临床脏腑病证的辨证和治疗,具有重要的指导意义。再如在确立肺行水理论的内涵及对此理论作深化研究的过程中,我们发现肺的行水功能与呼吸道的舒缩密切相关,因而在科学实验的基础上,提出肺阳行水的作用机制可能在于调节呼吸道的舒缩的假说。