阴阳学说贯穿于中医理论体系的各个方面，用以说明人体的组织结构、生理功能、病理变化，并有效指导着临床诊断、治疗、护理、预防和养生。

　　（一）说明人体的组织结构

　　人体是一个有机整体，根据部位和功能活动特性可分为阴阳两部分。就人体部位来说，上为阳，下为阴；背部为阳，腹部为阴；体表为阳，体内为阴。按照脏腑功能特点划分，心、肝、脾、肺、肾五脏为阴；胆、胃、小肠、大肠、膀胱、三焦六腑为阳：五脏之中，又各有阴阳所属，即心、肺居于上部（胸腔）属阳；肝、肾位于下部（腹腔）属阴；脾为至阴。若具体到每一脏腑，则又有阴阳之分，如心有心阴、心阳；肾有肾阴、肾阳。总之，人体组织结构的上下、内外、表里、前后各部分之间，以及内脏之间，无不包含着阴阳的对立统一。所以，《素问·宝命全形论》说：“人生有形，不离阴阳。”

　　（二）说明人体的生理功能

　　人体正常的生理活动，是阴阳两方面保持着对立统一的协调关系，使之处于动态平衡状态的结果。从阴阳角度来看，功能属阳，物质属阴，即组织结构和精、气、血、津液等物质属阴，脏腑组织器官和精、气、血、津液的生理功能属阳。物质是功能的基础，功能是物质的反映，两者之间不仅互相对立，而且互相依存。各种功能活动（阳）的产生，必然要消耗一定的营养物质（阴）；而各种营养物质（阴）的新陈代谢，又必定要消耗一定的能量（阳）。正常情况下，这种阴阳消长处手一种动态平衡之中，保证了脏腑功能的健全和正常的生理活动。如果阴阳不能保持相对的动态平衡而失调，乃至分离，人体就会生病以至死亡。所以说：“阴平阳秘，精神乃治；阴阳离绝，精气乃绝”（《素问·生气通天论》）。

　　（三）说明人体的病理变化

　　人体所有疾病的发生均可用阴阳失调来概括说明。一切疾病的发生、发展决定于正气和邪气两个方面。正气分阴阳，包括阴精和阳气两部分；邪气（致病因素）也有阴邪和阳邪之分。疾病发生、发展的过程，就是邪正斗争的过程，无论其病理变化如何复杂，都不外乎阴阳的偏胜或偏衰。阴或阳任何一方高于正常水平，必然导致另一方的相对不足而发病，即“阳胜则阴病”、“阴胜则阳病”、“阳胜则热”、“阴胜则寒”。反之，阴或阳任何一方的不足，必然导致另一方的相对亢盛而发病，即“阳虚则寒”、“阴虚则热”。此外，由于阴阳互根互用，当阳虚至一定程度时，因阳虚不能生化阴液而同时出现阴虚的现象，称“阳损及阴”；阴虚至一定程度时，因阴虚不能化生阳气而同时出现阳虚的现象，称“阴损及阳”。阳损及阴或阴损及阳最终可导致“阴阳两虚”。因阴阳失调而出现的病理现象，在一定的条件下，可向各自相反的方向转化，即阴证可以转化为阳证，阳证可以转化为阴证，所谓“重寒则热，重热则寒”，“重阴必阳，重阳必阴”（《素问·阴阳应象大论》）。

　　（四）用于疾病的诊断

　　任何疾病，尽管临床表现错综复杂，千变万化；病理变化复杂多端，究其基本机制是阴阳失调。用阴阳来概括疾病的病变部位、性质及各种证候的基本属性，作为辨证的纲领。故《素问·阴阳应象大论》说：“善诊者，察色按脉，先别阴阳”。

　　临床上常用的八纲辨证，是各种辨证的纲领，阴阳又是八纲的总纲，以统领表里、寒热、虚实，即表证、热证、实证属阳；里证、寒证、虚证属阴。正确的诊断，首先要分清阴阳，才能抓住疾病的本质，做到执简驭繁。

　　（五）用于疾病的防治

　　疾病发生、发展、变化的基本机制是阴阳失调，调整阴阳是中医学治疗、护理疾病的基本原则，也是阴阳学说用于疾病防治、护理的主要内容。调理阴阳，就是损其有余，补其不足，使阴阳重新恢复相对平衡状态。针对疾病阴阳偏胜、偏衰的状况，采取“实则泻之”、“虚则补之”的方法，达到“阴平阳秘”，使阴阳和调，恢复平衡。