肾的生理功能，肾藏精、肾主水、肾主纳气。《素问。宣明五气》曰：“肾主骨”，《素问。痿论》亦云：“肾主身之骨髓”，指出骨与肾的关系非常密切。

　　骨，即骨骼，为构成人体的支架，属于五体之一，是人体运动系统的主要组成成份。骨有腔，内容骨髓，故曰：“骨者，髓之府”（《素问。脉要精微论》），“髓者，骨之充也”（《素问。解精微论》）。骨由于其所居部位及形状不同，而分别发挥着支撑人体、保护内脏、主司运动等功能。《素问。经脉》所说“骨为干”，即是强调骨的支撑作用。

　　《素问。宣明五气》曰：“肾主骨”，《素问。痿论》亦云：“肾主身之骨髓”，指出骨与肾的关系非常密切。骨的生长发育及其修复皆以肾精为基础：肾藏精，精能生髓，髓能充骨，促进骨骼的生长发育，并使之发挥正常的生理功能。故曰：“肾生骨髓”（《素问。阴阳应象大论》），“藏真下于肾，肾藏骨髓之气也”（《素问。平人气象论》）。肾精充足，骨髓化生充足，骨骼得养，则骨骼坚实、强壮有力，肢体活动灵活，作用强力。如《四圣心源》所说：“骨以立其干……髓骨者，肾水之所生也，肾气盛则髓骨坚凝而轻利。”若肾精不足，骨髓化生乏源，骨失所养，则骨骼脆弱无力，在小儿，则见骨软无力，囱门迟闭，发育迟缓；在成人，则见腰膝酸软，肢软无力，或骨质脆弱，易于骨折等症。正如《素问。痿论》所说：“肾气热，则腰脊不举，骨枯而髓减，发为骨痿。”《素问。生气通天论》亦云：“因而强力，肾气乃伤，高骨乃坏。”

　　牙齿属人体骨骼之一，且为人体惟一外露的骨骼，故曰：“齿为骨之余”（叶天士《外感热病篇》），“齿者，髓之标，骨之本”（《杂病源流犀烛。口齿唇舌病源流》）。牙齿的营养亦源于肾精，故肾精充足，齿得所养，则齿坚有力，不易脱落；若肾精亏虚，齿失所养，则小儿牙齿生长迟缓，成人齿松易脱。正如清代程杏轩在《医参》中所述：“齿者，骨之聚也……肾主骨，齿落则肾衰矣。”

　　肾主骨理论在临床上对于骨病的诊治具有重要的意义。如临床上，可以通过观察牙齿的生长、脱落及其润泽情况，推测肾精的盛衰、津液的荣枯。故此清代杨士瀛在《仁斋直指方》中说：“齿者骨之所终，髓之所养，肾实主之。故肾衰则齿豁，肾盛则齿坚，虚热则齿动。”清代汪宏在《望诊遵经》中亦云：“然齿者，总谓口中之骨，……滋润者，津液犹充；干燥者，津液已耗。形色枯槁者，精气将竭；形色明亮者，精气未衰。”另外，亦可依据骨骼的坚脆、生长的迟速，诊察肾精的之盛衰。如见小儿生长发育迟缓，症见五迟五软，或见老人骨脆易折、难以愈合、不耐久立等，皆为肾精亏虚之证，以补肾填精之药治之，多获卓越效。即如虞抟在《医学正传》所说：“夫齿者，肾之标也，骨之余也……大抵齿龈露而动摇者，肾元虚也，治宜滋阴补肾为要。”