《黄帝内经》较系统地阐述了人体的形态结构、生理功能、病因病机，以及疾病的诊断、治疗、养生、防治等方面的内容，确立了中医药学理论的基本框架。《内经》首先运用了“解剖”的方法，提出了解剖学概念，并将解剖技术运用于医学研究，成为中医药学理论形成的主要条件之一。如《灵枢》指出：“若夫八尺之士，皮肉在此，外可度量切循而得之，其死可解剖而视之”。《内经》所载的人体骨骼、血脉长度、内脏器官大小和容量等，基本符合人体的实际情况。这些认识在某些方面虽然大多仍是宏观的表层观察，有一定局限性，但为藏象学说的形成，奠定了形态学的基础。

　　（二）疾病认识和治疗经验的积累

　　古代长期医疗实践用药经验的积累和反复验证，为中医药学理论和临床方药应用体系打下了丰厚的基础。如《五十二病方》记载病证52种，药物247种；十三经中记载病证180余种；《山海经》记载疾病38种，药物一百多种；《伤寒杂病论》进一步总结前人临床医学成就，确定了临床辨证论治及理法方药的医学实践体系；《神农本草经》载药365种，集东汉以前药物学研究和实践经验之大成，成为中药学发展的奠基之作，并大多数为药典所收载。

　　（三）社会科学、自然科学知识的渗透

　　古代“诸子百家”的学术争鸣和交流，为中医药学理论体系的确立奠定了社会科学和人文科学基础。而在其医学理论体系形成发展过程中，广泛吸纳了当时高度发展的天文、历法、气象学、地理学、物候学、数学等多学科知识，从而构成了《黄帝内经》博大精深的文化内涵和科学底蕴。

　　（四）古代哲学的影响

　　主要体现于应用精气学说（即气一元论）、阴阳学说和五行学说等方法论，将散在的医疗实践经验，通过归纳总结和分析研究，使之逐步系统化和理论化，从而使感性的医疗知识升华为理性的医学理论，上升为比较完整而系统的中医药学理论体系。