电镜下可见在靠近胞核的基底部有粗面内质网和高尔基复合体。而顶部细胞质内粗面内质网丰富。在牙本质形成活动期，细胞内高尔基复合体显著，粗面内质网丰富，线粒体分布于整个胞质内，并见空泡。牙本质中的胶原纤维和大部分非胶原代表都是成牙本质细胞分泌的。