影响牙本质-牙髓复合体反应的因素，一方面是微生物的种类、数量和毒性致病力；另一方面是机体抵抗力，如牙本质的厚度，即微生物及其代谢产物等引起破坏反应通过的厚度。此外，牙本质的结构和组成、钙化程度、牙本质内氟和其他一些微量元素含量，都会影响到破坏因子，如有机酸在牙本质内的渗透程度，从而影响牙齿的抗龋能力。从牙本质-牙髓复合体反应的个体差异性来看，与患者年龄、患牙的牙龄、髓腔和根管内牙髓组织的细胞和微循环状况关系密切。