2、 乙方申报设计变更增加费不符合约定。
理由：乙方已过索赔权利的时效，根据有关规定，乙方必须在发生索赔事项28天内经过工程师同意，提交索赔报告，但本案例三个月后才提，超出索赔时效，丧失要求索赔的权利，所以不赔。
3、 乙方不是逾期竣工。
因为造成该事件是由建设单位提出变更引起，非施工单位责任，所以应给予施工延长。甲方给乙方的费用索赔为20×5＝100万元，延长工期20天。