综合指标投资估算法是依据国家有关规定，国家或行业、地方的定额、指标和取费标准，以及设备和主材价格等，从工程费用中的单项工程人手，来估算初始投资。采用这种方法，还需要相关专业提供较为详细的资料，有一定的估算精度，精确度相对较高。

设备和工器具购置费估算。 分别估算各单项工程雄备和工器具购置费，需要主要设备的数量、出厂价格和相关运杂费资料，一般运杂费可按设备价格的百分比估算。主要设备以外的零星设备费可按占主要设备费的比例估算，工器具购置费一般也按占主要设备费的比例估算。

安装工程费估算。可行性研究阶段，安装工程费一般可以按照设备费的比例估算，该比例需要通过经验判定，并结合该装置的具体情况确定。

安装工程费也可按设备吨位乘以吨安装费指标，或安装实物量乘以相应的安装费指标估算。条件成熟的，可按概算法估算。

建筑工程费估算。建筑工程费的估算一般按单位综合指标法，即用工程量乘以相应的单位综合指标，如单位建筑面积（每平方米）投资，单位土石方（每立方米）投资，单位矿井巷道（每延米）投资，单位路面铺设（每平方米）投资等。条件成熟的，可按概算法估算。

其他费用的估算。其他费用种类较多，无论采用何种投资估算方法，一般其他费用都需要按照国家、地方或部门的有关规定逐项估算。要注意随地区和项目性质的不同，费用科目可能会有所不同。在项目的初期阶段，也可以按照工程费用的百分数综合估算。

基本预备费估算。基本预备费以工程费用、第二部分工程建设其他费用之和为基数，乘以适当的基本预备费率（百分数）估算。预备费率的取值一般按行业规定，并结合估算深度确定。

涨价预备费估算。一般以分年工程费用为基数，分别估算各年的涨价预备费，再进行加和，求得总的涨价预备费。