自然灾害往往造成大规模的人口迁徙。地震时，伤员后送直达各地。在城市重建期间，以投亲靠友的形式疏散出来的人口，几乎遍布整个中国。而在现今的经济条件下，灾区居民外出从事劳务活动，几乎成了生产自救活动中最重要的形式。

人口的大规模迁徙，首先是给一些地方病的蔓延创造了条件。历史上的一些著名的疾病大流行，如中世纪的黑死病，就是从人口流动开始的。

人口流动造成了两个方面的问题。当灾区的人口外流时，可能将灾区的地方性疾病传播到未受灾的地区；更重要的是，当灾区开始重建，人口陆续还乡时，又会将各地的地方性传染病带回灾区。如果受灾地区具备疾病流行的条件，甚至可能造成新的地方病区。

人口流动带来的第二个重大问题，是它干扰了一些主要依靠免疫控制的疾病的人群兔疫状态，造成局部的无免疫人群，从而为这些疾病的流行创造了条件。

在我国，计划免疫已相当广泛地开展，脊髓灰质炎，麻疹的控制已大见成效，伤寒，结核病和甲、乙型肝炎的发病率也已开始下降。由于灾害的干扰，使计划免疫工作难于正常进行，人群流动使部分儿童漏种疫苗，这些状态均有可能使这类疾病的发病率升高。

一些在儿童和青年中多发的疾病，人群的自然免疫状态在疾病的流行中起着重要作用。无论是灾区的人口外流，还是灾区重建时的人口还乡，都会使一些无免疫人口暴露在一个低水平自然流行的人群之中，从而造成这些疾病的发病率上升。