化学物进入机体后，对体内各器官的毒作用并不一样，往往有选择性，化学物直接发挥毒作用的器官就称为该物质的靶器官。毒效应的强弱，主要取决于毒物在靶器官中浓度。如脑是甲基汞的靶器官，肾是镉的靶器官。但靶器官不一定是该物质浓度最高的器官。例如铅浓集在骨中，但其靶器官为中枢神经系统和造血系统。同样DDT在脂肪中的浓度最高，但并不对该组织产生毒作用。在全身毒作用中常见的靶器官有肝、肾、血液、神经系统、肺等。