在凋亡中起一定作用的基因在不断增长。p53基因，有肿瘤抑制基因的作用，能促进凋亡或生长停止。在正常的发育期间出现的凋亡不需要p53基因，例如，有p53-缺陷的胚胎能正常发育。然而，p53可能在对DNA损伤的反应中对导致生长停止或凋亡有重要作用。如，与正常纯合子（十／十）的对照相比较，在杂合子p53缺陷（P／十）妊娠小鼠的子代中，苯并[a ]芘引起的胎儿吸收和产后死亡的发病率分别增加了3倍和10倍以上。生长因子和一些细胞因子（IL-3，IL-6）能预防p53-依赖的凋亡。
c-myc产物的表达使DNA持续不断地合成，而面临DNA损伤时它可能促成凋亡。Bcl-2有作为凋亡的阻遏物的功能和与类似物Bax结合的功能，Bax可与它自己或与Bcl-2成为二聚物。Bax同型二聚体促成细胞死亡，Bcl-2／Bax异型二聚体抑制细胞死亡。
已证实，致畸因子过高热、环磷酰胺或砷酸盐处理着床后的小鼠胚胎，在一些胚芽组织中与凋亡一起导致DNA断裂、caspase-3的话化和多聚（腺甘酸二磷酸-核糖）聚合酶（PABP）的分裂。这些因子还能引起胚胎线粒体的改变而造成细胞色素C的释放，并造成caspase-3上游的活化因子caspase-9的活化。
