终审计决定要求建设单位、施工、设计、监理等相关单位共同执行才能完成，而非建设单位一方执行即可，因此，仅对建设单位一方下达审计通知书，在审计决定执行主体上产生了法律偏差，导致审计决定不能得到有效地执行，甚至产生行政诉讼。当产生行政诉讼时，人民法院更多的是从审计执法程序上来认定审计决定的合法性，从而导致法院判决与审计决定不一致的结果。

在当前国家法律法规尚未修改前，充分利用地方立法来保证审计对国家建设项目合同中约定的违反工程结算规定或合同执行结果损害国家利益的监督作用。对建设单位来说，并非所有承担国家建设项目的建设单位都很懂得和掌握建筑工程、安装工程等专业性极强的专业知识，这样难免在建设项目招投标、概算、设计、施工等方面产生漏洞，而给国家造成损失。由于这种损失具有较大的隐蔽性，易被表面形式合法的合同所掩盖。对此，加强对国家建设项目的审计监督就更显必要。在当前状况下，可考虑各地审计机关在自己的职权范围内，积极向本级政府建议，由地方立法在本行政区域内，规定国家建设项目的工程结算必须经审计机关审计，其审计结论作为双方办理工程款结算的依据，将其纳入必经程序，其国家建设项目合同的签定必须符合这一规定。以地方法规的形式来解决现阶段存在的问题，作为一种过渡时期制度以保证国家资产不受损失。

综上所述，加强对国家建设项目的审计监督是国家利益的需要，也是《中华人民共和国审计法》赋予审计机关的权利。对建设工程合同行使好审计监督权，从合同上有效防范损害国家利益行为的产生。充分运用现有法律、法规坚持依法审计、客观公正，切实维护国家的利益和建设各方的合法权益。